Create a run summary word document
nmDocx(
x,
docxOut = NULL,
docxTemplate = NULL,
plot = TRUE,
titleStyle = getOption("nlmixr.docx.title", "Title"),
subtitleStyle = getOption("nlmixr.docx.subtitle", "Subtitle"),
normalStyle = getOption("nlmixr.docx.normal", "Normal"),
headerStyle = getOption("nlmixr.docx.heading1", "Heading 1"),
centeredStyle = getOption("nlmixr.docx.centered", "centered"),
preformattedStyle = getOption("nlmixr.docx.preformatted", "HTML Preformatted"),
width = getOption("nlmixr.docx.width", 69),
save = FALSE
)
nmSave(x, ..., save = TRUE)nlmixr fit object.
Output file for run information document. If not
specified it is the name of R object where the fit is located
with the -YEAR-MONTH-DAY.docx appended. If it is
NULL the document is not saved, but the officer
object is returned.
This is the document template. If not
specified it defaults to
option("nlmixr.docx.template"). If
option("nlmixr.docx.template") is not specified it uses
the included nlmixr document template. When
docxTemplate=NULL it uses the officer blank
document.
Boolean indicating if the default goodness of fit
plots are added to the document. By default TRUE
This is the word style name for the nlmixr
title; Usually this is nlmixr version (R
object). Defaults to option("nlmixr.docx.title") or
Title
This is the word style for the subtitle which
is nlmixr model name and date. Defaults to
option("nlmixr.docx.subtitle") or Subtitle
This is the word style for normal text. Defaults to
option("nlmixr.docx.normal") or Normal
This is the word style for heading text. Defaults to
option("nlmixr.docx.heading1") or Heading 1
This is the word style for centered text
which is used for the figures. Defaults to
option("nlmixr.docx.centered") or centered
This is the preformatted text style for R
output lines. Defaults to
option("nlmixr.docx.preformatted") or HTML Preformatted
Is an integer representing the number of characters
your preformatted style supports. By default this is
option("nlmixr.docx.width") or 69
Should the docx be saved in a zip file with the R rds
data object for the fit? By default this is FALSE with
nmDocx and TRUE with nmSave
when using `nmSave` these arguments are passed to `nmDocx`
An officer docx object
# \donttest{
library(nlmixr)
pheno <- function() {
# Pheno with covariance
ini({
tcl <- log(0.008) # typical value of clearance
tv <- log(0.6) # typical value of volume
## var(eta.cl)
eta.cl + eta.v ~ c(1,
0.01, 1) ## cov(eta.cl, eta.v), var(eta.v)
# interindividual variability on clearance and volume
add.err <- 0.1 # residual variability
})
model({
cl <- exp(tcl + eta.cl) # individual value of clearance
v <- exp(tv + eta.v) # individual value of volume
ke <- cl / v # elimination rate constant
d/dt(A1) = - ke * A1 # model differential equation
cp = A1 / v # concentration in plasma
cp ~ add(add.err) # define error model
})
}
fit.s <- nlmixr(pheno, pheno_sd, "saem")
#> ℹ parameter labels from comments will be replaced by 'label()'
#>
#> → generate SAEM model
#> ✔ done
#> 1: -5.0359 0.2663 0.9500 0.9500 57.8992
#> 2: -5.1889 0.3926 0.9025 0.9025 41.7667
#> 3: -5.3101 0.4225 0.8574 0.8574 29.8681
#> 4: -5.3731 0.4329 0.8145 0.8145 22.5301
#> 5: -5.5189 0.4195 0.7738 0.7738 16.9880
#> 6: -5.5092 0.4104 0.7351 0.7351 15.0575
#> 7: -5.4898 0.4010 0.6983 0.6983 14.3425
#> 8: -5.4838 0.4203 0.6634 0.6634 12.5614
#> 9: -5.4854 0.4203 0.6302 0.6302 11.2022
#> 10: -5.4476 0.4042 0.5987 0.5987 9.0113
#> 11: -5.4404 0.4132 0.5688 0.5688 9.8449
#> 12: -5.3835 0.4174 0.5404 0.5404 8.9020
#> 13: -5.3784 0.3866 0.5133 0.5133 7.9389
#> 14: -5.3393 0.3826 0.4877 0.4877 8.0370
#> 15: -5.3492 0.3853 0.4633 0.4633 8.7886
#> 16: -5.3128 0.3848 0.4401 0.4401 9.0697
#> 17: -5.2671 0.3847 0.4181 0.4181 8.3329
#> 18: -5.3051 0.3743 0.3972 0.3972 8.0292
#> 19: -5.2309 0.3648 0.3774 0.3774 7.7241
#> 20: -5.1893 0.3488 0.3585 0.3585 7.4189
#> 21: -5.1836 0.3726 0.3406 0.3406 7.2053
#> 22: -5.1668 0.3643 0.3235 0.3235 6.7400
#> 23: -5.2086 0.3620 0.3074 0.3074 7.3308
#> 24: -5.2072 0.3605 0.2958 0.2920 7.4623
#> 25: -5.2475 0.3717 0.2877 0.2774 7.6228
#> 26: -5.2588 0.3727 0.2904 0.2635 7.2070
#> 27: -5.2242 0.3830 0.2958 0.2503 6.9180
#> 28: -5.1947 0.3749 0.2810 0.2378 7.2450
#> 29: -5.2412 0.3756 0.2670 0.2259 7.9364
#> 30: -5.2152 0.3761 0.2536 0.2146 8.2754
#> 31: -5.1819 0.3731 0.2415 0.2039 7.7887
#> 32: -5.1790 0.3725 0.2682 0.1937 7.4837
#> 33: -5.1551 0.3560 0.2548 0.1958 8.5285
#> 34: -5.1690 0.3785 0.2421 0.1879 8.4316
#> 35: -5.1804 0.3712 0.2300 0.1989 8.4451
#> 36: -5.1959 0.3795 0.2185 0.2091 8.1348
#> 37: -5.2145 0.3692 0.2076 0.1986 8.5251
#> 38: -5.1880 0.3620 0.1999 0.2054 8.6286
#> 39: -5.1780 0.3612 0.1899 0.2020 8.5912
#> 40: -5.1894 0.3743 0.2070 0.2064 9.4070
#> 41: -5.1662 0.3768 0.1966 0.1985 9.3148
#> 42: -5.1527 0.3484 0.1917 0.1981 8.9524
#> 43: -5.1422 0.3694 0.1821 0.2039 8.7593
#> 44: -5.1418 0.3633 0.1730 0.2161 8.7221
#> 45: -5.1672 0.3681 0.1799 0.2114 8.3544
#> 46: -5.1805 0.3630 0.1875 0.2044 8.1314
#> 47: -5.1624 0.3642 0.2159 0.1971 8.2985
#> 48: -5.1677 0.3649 0.2211 0.1967 9.6814
#> 49: -5.1622 0.3643 0.2213 0.1869 9.4949
#> 50: -5.1646 0.3719 0.2294 0.1922 8.6191
#> 51: -5.1513 0.3667 0.2278 0.1923 8.8473
#> 52: -5.1565 0.3617 0.2336 0.1940 8.7060
#> 53: -5.1787 0.3834 0.2494 0.1930 9.2807
#> 54: -5.1976 0.3729 0.3016 0.1897 8.7931
#> 55: -5.2162 0.3784 0.2865 0.1935 7.7340
#> 56: -5.2002 0.3752 0.2722 0.2035 7.6944
#> 57: -5.1623 0.3644 0.2681 0.1933 8.2134
#> 58: -5.1542 0.3758 0.2547 0.1836 7.9217
#> 59: -5.1916 0.3715 0.2599 0.2001 7.4921
#> 60: -5.1811 0.3643 0.2559 0.1920 7.6357
#> 61: -5.2024 0.3782 0.3188 0.1870 8.1094
#> 62: -5.1633 0.3684 0.3029 0.1910 8.2306
#> 63: -5.2389 0.3693 0.2878 0.1814 8.4394
#> 64: -5.2283 0.3704 0.2734 0.1894 8.3236
#> 65: -5.2330 0.3764 0.2870 0.2014 7.6091
#> 66: -5.1767 0.3539 0.2727 0.1913 7.7561
#> 67: -5.1660 0.3644 0.2591 0.1946 7.2901
#> 68: -5.1912 0.3687 0.2461 0.1924 6.8679
#> 69: -5.1872 0.3623 0.2416 0.1867 6.8828
#> 70: -5.1607 0.3758 0.2456 0.1909 7.4610
#> 71: -5.1610 0.3683 0.2449 0.2091 7.9744
#> 72: -5.1758 0.3787 0.2347 0.1986 7.3759
#> 73: -5.1766 0.3693 0.2230 0.1938 7.9417
#> 74: -5.2362 0.3811 0.2151 0.2052 8.2163
#> 75: -5.2189 0.3710 0.2129 0.2013 8.5755
#> 76: -5.2045 0.3683 0.2022 0.2111 8.4615
#> 77: -5.2072 0.3683 0.1921 0.2015 8.2897
#> 78: -5.2114 0.3766 0.1935 0.2039 7.7556
#> 79: -5.2124 0.3751 0.1916 0.2032 8.0111
#> 80: -5.2396 0.3719 0.1820 0.2260 7.5432
#> 81: -5.2389 0.3773 0.1766 0.2201 7.7797
#> 82: -5.1866 0.3691 0.1687 0.2215 8.0363
#> 83: -5.1858 0.3576 0.1603 0.2129 8.5190
#> 84: -5.1487 0.3499 0.1611 0.2214 8.3299
#> 85: -5.1543 0.3622 0.1585 0.2104 8.7578
#> 86: -5.1824 0.3674 0.1541 0.1998 8.5612
#> 87: -5.1439 0.3570 0.1613 0.2024 8.4641
#> 88: -5.1443 0.3588 0.1620 0.2086 9.0916
#> 89: -5.1699 0.3636 0.1668 0.1982 9.0053
#> 90: -5.1817 0.3665 0.1814 0.2117 8.8737
#> 91: -5.1593 0.3737 0.1838 0.2105 8.6212
#> 92: -5.1906 0.3525 0.1766 0.2014 8.0170
#> 93: -5.1874 0.3756 0.2142 0.2112 7.9887
#> 94: -5.1986 0.3603 0.2192 0.2111 8.1652
#> 95: -5.1819 0.3838 0.2239 0.2005 9.2053
#> 96: -5.1624 0.3625 0.2127 0.2271 8.3498
#> 97: -5.1369 0.3648 0.2021 0.2158 8.2901
#> 98: -5.1505 0.3598 0.1920 0.2107 8.1688
#> 99: -5.1660 0.3725 0.2012 0.2002 7.9863
#> 100: -5.2007 0.3717 0.2158 0.1981 7.1822
#> 101: -5.1943 0.3696 0.2057 0.2098 8.1001
#> 102: -5.1562 0.3591 0.1954 0.2214 8.6574
#> 103: -5.1252 0.3616 0.1857 0.2104 7.8677
#> 104: -5.1353 0.3552 0.2073 0.2082 7.6256
#> 105: -5.1297 0.3531 0.2232 0.2000 7.8383
#> 106: -5.1834 0.3665 0.2303 0.2025 7.4169
#> 107: -5.1646 0.3574 0.2310 0.1981 7.0770
#> 108: -5.1234 0.3718 0.2291 0.2097 7.1829
#> 109: -5.1501 0.3686 0.2465 0.1992 7.1778
#> 110: -5.1777 0.3742 0.2413 0.1892 7.4347
#> 111: -5.1693 0.3690 0.2418 0.1894 7.4731
#> 112: -5.1979 0.3623 0.2392 0.2060 7.2989
#> 113: -5.1863 0.3641 0.2378 0.1957 7.4889
#> 114: -5.1774 0.3695 0.2546 0.1958 7.6738
#> 115: -5.2043 0.3823 0.2529 0.2026 7.7646
#> 116: -5.1539 0.3533 0.2414 0.2165 7.8500
#> 117: -5.1477 0.3651 0.2293 0.2160 8.2157
#> 118: -5.1489 0.3632 0.2178 0.2083 8.2006
#> 119: -5.1454 0.3773 0.2086 0.1979 7.7287
#> 120: -5.1785 0.3587 0.2364 0.1880 7.8211
#> 121: -5.2043 0.3683 0.2246 0.1976 7.6115
#> 122: -5.1648 0.3539 0.2240 0.1985 7.8621
#> 123: -5.1518 0.3624 0.2446 0.1907 7.7152
#> 124: -5.1391 0.3528 0.2655 0.1871 7.5348
#> 125: -5.1501 0.3662 0.2522 0.1954 7.6286
#> 126: -5.1652 0.3596 0.2485 0.1863 7.4144
#> 127: -5.1609 0.3612 0.2553 0.1803 7.5299
#> 128: -5.2113 0.3700 0.2426 0.1922 7.2630
#> 129: -5.1993 0.3712 0.2365 0.1839 7.5161
#> 130: -5.1960 0.3749 0.2314 0.1884 7.4384
#> 131: -5.1796 0.3669 0.2371 0.2029 7.6925
#> 132: -5.1663 0.3623 0.2610 0.2066 7.8105
#> 133: -5.1622 0.3648 0.2480 0.2046 6.7284
#> 134: -5.1993 0.3638 0.2356 0.2087 7.4467
#> 135: -5.2133 0.3851 0.2238 0.2005 7.4995
#> 136: -5.2066 0.3977 0.2126 0.2042 7.8724
#> 137: -5.1792 0.3705 0.2069 0.1996 7.4733
#> 138: -5.1560 0.3591 0.2209 0.2038 7.4087
#> 139: -5.1415 0.3677 0.2099 0.1994 8.0960
#> 140: -5.1327 0.3677 0.2262 0.2007 7.7773
#> 141: -5.1385 0.3537 0.2286 0.1987 7.9027
#> 142: -5.1682 0.3602 0.2191 0.1981 8.0387
#> 143: -5.1239 0.3500 0.2337 0.1957 7.8361
#> 144: -5.1246 0.3450 0.2579 0.1859 8.0069
#> 145: -5.1044 0.3561 0.2450 0.1962 7.6904
#> 146: -5.0630 0.3422 0.2327 0.2015 7.4451
#> 147: -5.0919 0.3633 0.2329 0.1914 7.4583
#> 148: -5.1172 0.3514 0.2212 0.1856 7.6795
#> 149: -5.1110 0.3676 0.2102 0.2064 7.6409
#> 150: -5.1329 0.3601 0.2023 0.2077 7.4696
#> 151: -5.1565 0.3658 0.1921 0.2051 7.3003
#> 152: -5.1531 0.3574 0.1860 0.2075 7.6912
#> 153: -5.1368 0.3598 0.1992 0.2042 7.0819
#> 154: -5.1197 0.3576 0.2125 0.1981 7.4606
#> 155: -5.0971 0.3401 0.2141 0.1955 7.6490
#> 156: -5.0993 0.3455 0.2125 0.1741 7.5645
#> 157: -5.0863 0.3614 0.2182 0.1783 7.0782
#> 158: -5.0887 0.3495 0.2314 0.1826 7.5388
#> 159: -5.0783 0.3541 0.2244 0.1792 7.3034
#> 160: -5.0690 0.3617 0.2322 0.1791 7.0222
#> 161: -5.0420 0.3536 0.2103 0.1733 7.6565
#> 162: -5.0536 0.3558 0.2393 0.1757 7.5488
#> 163: -5.0332 0.3611 0.2256 0.1879 6.9114
#> 164: -5.0432 0.3481 0.2335 0.1786 6.7526
#> 165: -5.0435 0.3599 0.2271 0.1632 6.8728
#> 166: -5.0419 0.3608 0.2469 0.1687 7.3423
#> 167: -5.0442 0.3506 0.2255 0.1617 6.8157
#> 168: -5.0297 0.3465 0.2315 0.1720 7.1303
#> 169: -5.0318 0.3551 0.2259 0.1649 7.6775
#> 170: -5.0332 0.3582 0.2416 0.1552 7.4090
#> 171: -5.0230 0.3620 0.2410 0.1591 6.9659
#> 172: -5.0301 0.3491 0.2651 0.1635 6.7796
#> 173: -5.0273 0.3547 0.2645 0.1665 6.7502
#> 174: -5.0154 0.3548 0.2674 0.1538 7.0588
#> 175: -5.0047 0.3461 0.2630 0.1487 7.1087
#> 176: -5.0060 0.3461 0.2748 0.1526 7.1074
#> 177: -5.0056 0.3470 0.2775 0.1485 7.6389
#> 178: -5.0244 0.3350 0.2860 0.1484 7.6941
#> 179: -5.0223 0.3386 0.2933 0.1549 7.7922
#> 180: -5.0102 0.3462 0.2873 0.1492 7.1890
#> 181: -5.0073 0.3575 0.2806 0.1442 7.9706
#> 182: -5.0152 0.3577 0.2805 0.1421 7.8807
#> 183: -5.0077 0.3586 0.2979 0.1490 7.3785
#> 184: -5.0122 0.3535 0.2704 0.1473 7.9537
#> 185: -5.0083 0.3562 0.2719 0.1552 8.2670
#> 186: -4.9963 0.3612 0.2887 0.1669 8.1549
#> 187: -4.9958 0.3501 0.2527 0.1467 8.2338
#> 188: -5.0026 0.3483 0.2576 0.1549 8.3997
#> 189: -4.9937 0.3556 0.2666 0.1536 8.1778
#> 190: -4.9911 0.3640 0.2538 0.1506 8.7438
#> 191: -5.0084 0.3572 0.2577 0.1508 8.7269
#> 192: -5.0037 0.3610 0.2630 0.1492 8.6486
#> 193: -5.0301 0.3479 0.2604 0.1491 8.3267
#> 194: -5.0106 0.3644 0.2520 0.1503 8.3641
#> 195: -5.0221 0.3536 0.2463 0.1423 8.3655
#> 196: -5.0220 0.3564 0.2572 0.1450 8.1480
#> 197: -5.0171 0.3582 0.2539 0.1427 7.9381
#> 198: -5.0200 0.3427 0.2485 0.1376 7.8716
#> 199: -5.0277 0.3406 0.2546 0.1448 7.7382
#> 200: -5.0182 0.3441 0.2495 0.1455 7.9370
#> 201: -5.0180 0.3445 0.2514 0.1447 7.8544
#> 202: -5.0201 0.3443 0.2566 0.1474 7.8523
#> 203: -5.0192 0.3464 0.2594 0.1476 7.8785
#> 204: -5.0173 0.3482 0.2597 0.1481 7.8679
#> 205: -5.0156 0.3497 0.2579 0.1472 7.8203
#> 206: -5.0142 0.3498 0.2573 0.1467 7.8232
#> 207: -5.0151 0.3489 0.2576 0.1466 7.8045
#> 208: -5.0157 0.3485 0.2566 0.1465 7.7664
#> 209: -5.0157 0.3487 0.2557 0.1464 7.7955
#> 210: -5.0158 0.3491 0.2552 0.1460 7.7491
#> 211: -5.0158 0.3488 0.2557 0.1457 7.7528
#> 212: -5.0157 0.3486 0.2556 0.1458 7.7560
#> 213: -5.0155 0.3491 0.2559 0.1456 7.7830
#> 214: -5.0152 0.3494 0.2557 0.1459 7.8280
#> 215: -5.0152 0.3496 0.2557 0.1458 7.8562
#> 216: -5.0158 0.3493 0.2561 0.1459 7.8671
#> 217: -5.0162 0.3488 0.2556 0.1458 7.8829
#> 218: -5.0161 0.3488 0.2554 0.1454 7.8879
#> 219: -5.0166 0.3485 0.2551 0.1455 7.8698
#> 220: -5.0162 0.3488 0.2554 0.1458 7.8821
#> 221: -5.0158 0.3491 0.2556 0.1460 7.8931
#> 222: -5.0156 0.3493 0.2556 0.1461 7.8937
#> 223: -5.0148 0.3499 0.2566 0.1467 7.9028
#> 224: -5.0140 0.3500 0.2572 0.1471 7.9160
#> 225: -5.0139 0.3501 0.2579 0.1474 7.9400
#> 226: -5.0138 0.3501 0.2583 0.1480 7.9405
#> 227: -5.0136 0.3504 0.2590 0.1483 7.9564
#> 228: -5.0136 0.3502 0.2593 0.1485 7.9369
#> 229: -5.0138 0.3500 0.2591 0.1484 7.9169
#> 230: -5.0142 0.3496 0.2588 0.1481 7.9359
#> 231: -5.0142 0.3492 0.2585 0.1480 7.9489
#> 232: -5.0142 0.3491 0.2585 0.1481 7.9415
#> 233: -5.0143 0.3489 0.2585 0.1483 7.9402
#> 234: -5.0145 0.3488 0.2588 0.1484 7.9279
#> 235: -5.0140 0.3492 0.2587 0.1485 7.9340
#> 236: -5.0138 0.3494 0.2589 0.1486 7.9225
#> 237: -5.0137 0.3494 0.2590 0.1486 7.9169
#> 238: -5.0137 0.3495 0.2593 0.1487 7.9184
#> 239: -5.0136 0.3496 0.2593 0.1487 7.9260
#> 240: -5.0140 0.3495 0.2597 0.1488 7.9389
#> 241: -5.0140 0.3497 0.2601 0.1490 7.9397
#> 242: -5.0137 0.3499 0.2602 0.1491 7.9389
#> 243: -5.0138 0.3499 0.2602 0.1491 7.9372
#> 244: -5.0139 0.3499 0.2601 0.1491 7.9387
#> 245: -5.0137 0.3500 0.2602 0.1492 7.9309
#> 246: -5.0136 0.3500 0.2603 0.1494 7.9216
#> 247: -5.0138 0.3499 0.2605 0.1494 7.9088
#> 248: -5.0140 0.3499 0.2605 0.1493 7.8965
#> 249: -5.0140 0.3498 0.2607 0.1494 7.8929
#> 250: -5.0138 0.3499 0.2609 0.1496 7.8945
#> 251: -5.0140 0.3497 0.2611 0.1497 7.8972
#> 252: -5.0139 0.3498 0.2612 0.1497 7.9028
#> 253: -5.0140 0.3498 0.2613 0.1498 7.9044
#> 254: -5.0142 0.3497 0.2614 0.1498 7.9049
#> 255: -5.0144 0.3495 0.2614 0.1498 7.9028
#> 256: -5.0146 0.3494 0.2616 0.1500 7.9041
#> 257: -5.0149 0.3493 0.2618 0.1501 7.9012
#> 258: -5.0147 0.3494 0.2617 0.1501 7.9116
#> 259: -5.0145 0.3496 0.2617 0.1501 7.9154
#> 260: -5.0145 0.3497 0.2618 0.1500 7.9143
#> 261: -5.0145 0.3497 0.2619 0.1501 7.9225
#> 262: -5.0145 0.3497 0.2620 0.1501 7.9246
#> 263: -5.0146 0.3497 0.2621 0.1500 7.9210
#> 264: -5.0144 0.3498 0.2619 0.1500 7.9223
#> 265: -5.0144 0.3498 0.2617 0.1498 7.9233
#> 266: -5.0144 0.3498 0.2616 0.1498 7.9211
#> 267: -5.0143 0.3499 0.2614 0.1497 7.9189
#> 268: -5.0143 0.3499 0.2615 0.1498 7.9227
#> 269: -5.0143 0.3498 0.2614 0.1498 7.9203
#> 270: -5.0143 0.3498 0.2612 0.1497 7.9153
#> 271: -5.0142 0.3498 0.2611 0.1496 7.9235
#> 272: -5.0140 0.3500 0.2609 0.1496 7.9260
#> 273: -5.0140 0.3500 0.2608 0.1496 7.9233
#> 274: -5.0138 0.3502 0.2609 0.1496 7.9235
#> 275: -5.0137 0.3502 0.2608 0.1496 7.9292
#> 276: -5.0138 0.3501 0.2608 0.1496 7.9281
#> 277: -5.0140 0.3500 0.2607 0.1495 7.9296
#> 278: -5.0140 0.3500 0.2607 0.1495 7.9326
#> 279: -5.0140 0.3500 0.2608 0.1495 7.9396
#> 280: -5.0140 0.3500 0.2609 0.1496 7.9454
#> 281: -5.0139 0.3500 0.2609 0.1496 7.9521
#> 282: -5.0139 0.3501 0.2609 0.1496 7.9582
#> 283: -5.0137 0.3502 0.2608 0.1496 7.9597
#> 284: -5.0136 0.3503 0.2608 0.1497 7.9604
#> 285: -5.0135 0.3503 0.2607 0.1497 7.9625
#> 286: -5.0134 0.3504 0.2607 0.1496 7.9654
#> 287: -5.0132 0.3506 0.2606 0.1496 7.9624
#> 288: -5.0132 0.3506 0.2606 0.1496 7.9614
#> 289: -5.0132 0.3506 0.2607 0.1497 7.9600
#> 290: -5.0132 0.3506 0.2607 0.1496 7.9554
#> 291: -5.0132 0.3508 0.2607 0.1496 7.9612
#> 292: -5.0134 0.3507 0.2607 0.1496 7.9645
#> 293: -5.0133 0.3508 0.2608 0.1497 7.9692
#> 294: -5.0132 0.3508 0.2609 0.1498 7.9733
#> 295: -5.0130 0.3508 0.2611 0.1499 7.9708
#> 296: -5.0127 0.3510 0.2611 0.1499 7.9714
#> 297: -5.0125 0.3511 0.2613 0.1500 7.9750
#> 298: -5.0122 0.3512 0.2614 0.1500 7.9755
#> 299: -5.0121 0.3513 0.2615 0.1499 7.9721
#> 300: -5.0121 0.3513 0.2617 0.1500 7.9683
#> 301: -5.0120 0.3514 0.2616 0.1500 7.9703
#> 302: -5.0119 0.3515 0.2616 0.1499 7.9715
#> 303: -5.0117 0.3516 0.2615 0.1499 7.9705
#> 304: -5.0117 0.3516 0.2615 0.1499 7.9705
#> 305: -5.0118 0.3515 0.2615 0.1500 7.9710
#> 306: -5.0117 0.3516 0.2615 0.1501 7.9739
#> 307: -5.0116 0.3516 0.2615 0.1500 7.9785
#> 308: -5.0116 0.3516 0.2616 0.1500 7.9781
#> 309: -5.0115 0.3516 0.2616 0.1500 7.9849
#> 310: -5.0116 0.3515 0.2615 0.1499 7.9925
#> 311: -5.0117 0.3515 0.2614 0.1499 7.9960
#> 312: -5.0117 0.3515 0.2614 0.1499 7.9945
#> 313: -5.0115 0.3515 0.2614 0.1499 7.9965
#> 314: -5.0115 0.3515 0.2615 0.1500 8.0009
#> 315: -5.0114 0.3515 0.2616 0.1500 7.9996
#> 316: -5.0114 0.3515 0.2616 0.1501 7.9995
#> 317: -5.0113 0.3516 0.2618 0.1501 8.0030
#> 318: -5.0113 0.3516 0.2618 0.1501 8.0007
#> 319: -5.0114 0.3514 0.2618 0.1501 8.0001
#> 320: -5.0115 0.3514 0.2617 0.1501 7.9996
#> 321: -5.0115 0.3514 0.2616 0.1501 7.9993
#> 322: -5.0116 0.3513 0.2616 0.1500 8.0007
#> 323: -5.0117 0.3512 0.2617 0.1500 8.0027
#> 324: -5.0117 0.3512 0.2617 0.1500 8.0028
#> 325: -5.0116 0.3512 0.2617 0.1500 8.0099
#> 326: -5.0116 0.3512 0.2616 0.1499 8.0115
#> 327: -5.0116 0.3512 0.2616 0.1499 8.0118
#> 328: -5.0116 0.3512 0.2615 0.1499 8.0143
#> 329: -5.0115 0.3513 0.2614 0.1499 8.0187
#> 330: -5.0115 0.3514 0.2614 0.1498 8.0205
#> 331: -5.0115 0.3513 0.2613 0.1498 8.0192
#> 332: -5.0115 0.3513 0.2611 0.1497 8.0214
#> 333: -5.0114 0.3512 0.2611 0.1496 8.0203
#> 334: -5.0114 0.3513 0.2610 0.1496 8.0235
#> 335: -5.0114 0.3512 0.2611 0.1497 8.0232
#> 336: -5.0115 0.3512 0.2610 0.1496 8.0177
#> 337: -5.0116 0.3511 0.2609 0.1496 8.0147
#> 338: -5.0115 0.3512 0.2610 0.1497 8.0147
#> 339: -5.0114 0.3512 0.2610 0.1497 8.0174
#> 340: -5.0114 0.3512 0.2610 0.1497 8.0183
#> 341: -5.0113 0.3512 0.2611 0.1497 8.0224
#> 342: -5.0114 0.3512 0.2612 0.1498 8.0241
#> 343: -5.0114 0.3512 0.2612 0.1498 8.0215
#> 344: -5.0114 0.3512 0.2613 0.1499 8.0189
#> 345: -5.0115 0.3511 0.2613 0.1499 8.0168
#> 346: -5.0114 0.3511 0.2613 0.1500 8.0204
#> 347: -5.0115 0.3511 0.2613 0.1499 8.0225
#> 348: -5.0114 0.3512 0.2614 0.1500 8.0218
#> 349: -5.0113 0.3512 0.2614 0.1500 8.0202
#> 350: -5.0114 0.3511 0.2615 0.1501 8.0193
#> 351: -5.0115 0.3511 0.2616 0.1501 8.0176
#> 352: -5.0115 0.3511 0.2616 0.1501 8.0170
#> 353: -5.0116 0.3510 0.2615 0.1501 8.0141
#> 354: -5.0117 0.3510 0.2616 0.1501 8.0195
#> 355: -5.0117 0.3509 0.2615 0.1501 8.0240
#> 356: -5.0118 0.3509 0.2615 0.1501 8.0227
#> 357: -5.0117 0.3509 0.2614 0.1501 8.0207
#> 358: -5.0118 0.3509 0.2614 0.1501 8.0196
#> 359: -5.0119 0.3509 0.2615 0.1501 8.0175
#> 360: -5.0120 0.3508 0.2615 0.1501 8.0161
#> 361: -5.0121 0.3508 0.2616 0.1501 8.0194
#> 362: -5.0121 0.3508 0.2615 0.1501 8.0189
#> 363: -5.0121 0.3508 0.2616 0.1501 8.0135
#> 364: -5.0121 0.3507 0.2616 0.1502 8.0094
#> 365: -5.0121 0.3507 0.2616 0.1502 8.0080
#> 366: -5.0121 0.3508 0.2616 0.1502 8.0070
#> 367: -5.0120 0.3508 0.2615 0.1502 8.0056
#> 368: -5.0120 0.3508 0.2616 0.1502 8.0054
#> 369: -5.0119 0.3509 0.2616 0.1503 8.0063
#> 370: -5.0119 0.3508 0.2616 0.1502 8.0051
#> 371: -5.0120 0.3507 0.2615 0.1502 8.0037
#> 372: -5.0121 0.3507 0.2614 0.1501 8.0028
#> 373: -5.0121 0.3507 0.2613 0.1501 8.0013
#> 374: -5.0120 0.3507 0.2613 0.1501 7.9996
#> 375: -5.0120 0.3507 0.2612 0.1501 8.0012
#> 376: -5.0120 0.3507 0.2611 0.1500 8.0052
#> 377: -5.0120 0.3507 0.2611 0.1500 8.0067
#> 378: -5.0119 0.3508 0.2611 0.1500 8.0080
#> 379: -5.0120 0.3507 0.2610 0.1500 8.0108
#> 380: -5.0119 0.3508 0.2609 0.1500 8.0158
#> 381: -5.0119 0.3507 0.2609 0.1499 8.0174
#> 382: -5.0119 0.3507 0.2609 0.1499 8.0197
#> 383: -5.0119 0.3508 0.2609 0.1499 8.0198
#> 384: -5.0118 0.3508 0.2609 0.1499 8.0189
#> 385: -5.0118 0.3508 0.2609 0.1500 8.0199
#> 386: -5.0118 0.3508 0.2610 0.1500 8.0183
#> 387: -5.0119 0.3507 0.2611 0.1500 8.0196
#> 388: -5.0118 0.3507 0.2612 0.1501 8.0194
#> 389: -5.0118 0.3507 0.2612 0.1501 8.0184
#> 390: -5.0118 0.3507 0.2613 0.1502 8.0200
#> 391: -5.0117 0.3508 0.2613 0.1502 8.0226
#> 392: -5.0117 0.3508 0.2613 0.1502 8.0229
#> 393: -5.0117 0.3508 0.2613 0.1502 8.0251
#> 394: -5.0116 0.3508 0.2613 0.1502 8.0253
#> 395: -5.0117 0.3509 0.2614 0.1501 8.0244
#> 396: -5.0117 0.3508 0.2614 0.1501 8.0219
#> 397: -5.0117 0.3508 0.2614 0.1501 8.0214
#> 398: -5.0117 0.3508 0.2614 0.1502 8.0217
#> 399: -5.0118 0.3508 0.2615 0.1502 8.0181
#> 400: -5.0118 0.3509 0.2615 0.1502 8.0184
#> 401: -5.0117 0.3509 0.2615 0.1502 8.0204
#> 402: -5.0118 0.3509 0.2615 0.1502 8.0216
#> 403: -5.0117 0.3509 0.2615 0.1502 8.0213
#> 404: -5.0116 0.3509 0.2614 0.1501 8.0247
#> 405: -5.0115 0.3510 0.2615 0.1501 8.0270
#> 406: -5.0115 0.3510 0.2615 0.1501 8.0295
#> 407: -5.0114 0.3511 0.2614 0.1501 8.0282
#> 408: -5.0114 0.3511 0.2614 0.1501 8.0267
#> 409: -5.0115 0.3510 0.2613 0.1501 8.0238
#> 410: -5.0115 0.3510 0.2614 0.1501 8.0244
#> 411: -5.0115 0.3510 0.2614 0.1502 8.0251
#> 412: -5.0115 0.3510 0.2615 0.1502 8.0243
#> 413: -5.0115 0.3509 0.2615 0.1503 8.0254
#> 414: -5.0114 0.3510 0.2616 0.1503 8.0268
#> 415: -5.0114 0.3509 0.2616 0.1503 8.0278
#> 416: -5.0113 0.3510 0.2616 0.1503 8.0291
#> 417: -5.0112 0.3511 0.2616 0.1503 8.0306
#> 418: -5.0112 0.3511 0.2616 0.1503 8.0308
#> 419: -5.0111 0.3511 0.2616 0.1503 8.0324
#> 420: -5.0111 0.3511 0.2616 0.1504 8.0340
#> 421: -5.0110 0.3511 0.2616 0.1504 8.0346
#> 422: -5.0111 0.3511 0.2616 0.1504 8.0338
#> 423: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1504 8.0337
#> 424: -5.0111 0.3512 0.2615 0.1504 8.0331
#> 425: -5.0110 0.3512 0.2616 0.1503 8.0331
#> 426: -5.0110 0.3513 0.2616 0.1504 8.0313
#> 427: -5.0110 0.3513 0.2616 0.1504 8.0332
#> 428: -5.0110 0.3513 0.2616 0.1504 8.0358
#> 429: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1504 8.0359
#> 430: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1504 8.0361
#> 431: -5.0110 0.3512 0.2616 0.1504 8.0371
#> 432: -5.0110 0.3513 0.2616 0.1505 8.0390
#> 433: -5.0110 0.3512 0.2617 0.1505 8.0373
#> 434: -5.0111 0.3512 0.2617 0.1505 8.0356
#> 435: -5.0112 0.3512 0.2617 0.1505 8.0351
#> 436: -5.0111 0.3512 0.2617 0.1505 8.0341
#> 437: -5.0111 0.3511 0.2617 0.1505 8.0327
#> 438: -5.0111 0.3512 0.2617 0.1505 8.0332
#> 439: -5.0112 0.3512 0.2617 0.1505 8.0316
#> 440: -5.0111 0.3512 0.2617 0.1505 8.0292
#> 441: -5.0111 0.3512 0.2618 0.1505 8.0277
#> 442: -5.0110 0.3512 0.2618 0.1506 8.0290
#> 443: -5.0110 0.3513 0.2618 0.1506 8.0311
#> 444: -5.0111 0.3513 0.2618 0.1505 8.0310
#> 445: -5.0111 0.3513 0.2618 0.1505 8.0301
#> 446: -5.0110 0.3513 0.2618 0.1506 8.0285
#> 447: -5.0110 0.3513 0.2619 0.1506 8.0275
#> 448: -5.0109 0.3514 0.2619 0.1506 8.0274
#> 449: -5.0109 0.3514 0.2618 0.1506 8.0273
#> 450: -5.0109 0.3514 0.2618 0.1505 8.0294
#> 451: -5.0108 0.3514 0.2617 0.1505 8.0296
#> 452: -5.0109 0.3514 0.2617 0.1505 8.0284
#> 453: -5.0109 0.3514 0.2616 0.1505 8.0289
#> 454: -5.0109 0.3514 0.2616 0.1504 8.0297
#> 455: -5.0110 0.3514 0.2615 0.1504 8.0294
#> 456: -5.0109 0.3514 0.2615 0.1503 8.0288
#> 457: -5.0110 0.3513 0.2614 0.1503 8.0272
#> 458: -5.0110 0.3514 0.2614 0.1503 8.0280
#> 459: -5.0110 0.3513 0.2614 0.1503 8.0288
#> 460: -5.0110 0.3513 0.2614 0.1503 8.0277
#> 461: -5.0111 0.3513 0.2614 0.1503 8.0247
#> 462: -5.0111 0.3513 0.2614 0.1503 8.0245
#> 463: -5.0111 0.3513 0.2613 0.1503 8.0228
#> 464: -5.0111 0.3513 0.2613 0.1503 8.0235
#> 465: -5.0111 0.3513 0.2613 0.1503 8.0219
#> 466: -5.0111 0.3513 0.2613 0.1503 8.0212
#> 467: -5.0111 0.3513 0.2614 0.1503 8.0232
#> 468: -5.0110 0.3514 0.2613 0.1503 8.0237
#> 469: -5.0111 0.3513 0.2613 0.1503 8.0245
#> 470: -5.0110 0.3513 0.2614 0.1503 8.0265
#> 471: -5.0110 0.3513 0.2614 0.1503 8.0291
#> 472: -5.0110 0.3514 0.2614 0.1504 8.0308
#> 473: -5.0110 0.3514 0.2614 0.1504 8.0326
#> 474: -5.0110 0.3514 0.2614 0.1503 8.0329
#> 475: -5.0110 0.3514 0.2614 0.1504 8.0334
#> 476: -5.0110 0.3514 0.2615 0.1504 8.0352
#> 477: -5.0110 0.3513 0.2615 0.1504 8.0356
#> 478: -5.0110 0.3513 0.2615 0.1504 8.0346
#> 479: -5.0111 0.3513 0.2615 0.1504 8.0339
#> 480: -5.0111 0.3513 0.2616 0.1505 8.0344
#> 481: -5.0111 0.3513 0.2616 0.1505 8.0341
#> 482: -5.0111 0.3513 0.2616 0.1505 8.0340
#> 483: -5.0111 0.3513 0.2616 0.1505 8.0350
#> 484: -5.0111 0.3512 0.2615 0.1505 8.0347
#> 485: -5.0111 0.3512 0.2615 0.1505 8.0336
#> 486: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1505 8.0310
#> 487: -5.0111 0.3512 0.2615 0.1505 8.0304
#> 488: -5.0111 0.3512 0.2615 0.1505 8.0325
#> 489: -5.0112 0.3512 0.2616 0.1505 8.0322
#> 490: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1505 8.0327
#> 491: -5.0111 0.3512 0.2617 0.1505 8.0325
#> 492: -5.0111 0.3512 0.2617 0.1505 8.0328
#> 493: -5.0111 0.3512 0.2617 0.1505 8.0347
#> 494: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1505 8.0353
#> 495: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1505 8.0360
#> 496: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1505 8.0375
#> 497: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1505 8.0390
#> 498: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1505 8.0389
#> 499: -5.0111 0.3512 0.2616 0.1505 8.0401
#> 500: -5.0111 0.3512 0.2615 0.1505 8.0418
#> Calculating covariance matrix
#>
#> → creating full model...
#> → pruning branches (`if`/`else`)...
#> ✔ done
#> → loading into symengine environment...
#> ✔ done
#> → compiling EBE model...
#>
#> ✔ done
#> Calculating residuals/tables
#> done
## Save output information into a word document
RxODE::.rxWithWd(tempdir(), # Put document in temporary directory
nmDocx(fit.s)
)
#> Calculating -2LL by Gaussian quadrature (nnodes=3,nsd=1.6)
#>
#> Warning: Unrecognized statistics: r.squared
#> Try setting `statistics` explicitly in the call to `huxreg()`
#> Error in read_xml.raw(charToRaw(enc2utf8(x)), "UTF-8", ..., as_html = as_html, options = options): PCDATA invalid Char value 27 [9]
# }